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檢測領(lǐng)域:

成分分析,配方還原,食品檢測,藥品檢測,化妝品檢測,環(huán)境檢測,性能檢測,耐熱性檢測,安全性能檢測,水質(zhì)檢測,氣體檢測,工業(yè)問題診斷,未知成分分析,塑料檢測,橡膠檢測,金屬元素檢測,礦石檢測,有毒有害檢測,土壤檢測,msds報告編寫等。

外顯子組測序檢測

發(fā)布時間:2025-07-01

關(guān)鍵詞:外顯子組測序測試周期,外顯子組測序測試范圍,外顯子組測序測試機(jī)構(gòu)

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來源:北京中科光析科學(xué)技術(shù)研究所

文章簡介:

外顯子組測序檢測專注于基因組編碼區(qū)域的變異分析,核心檢測要素包括目標(biāo)區(qū)域覆蓋深度一致性、序列質(zhì)量評分控制和變異檢出準(zhǔn)確性。該技術(shù)用于識別單核苷酸變異、插入缺失等遺傳改變,應(yīng)用在臨床診斷和科研領(lǐng)域,需遵循嚴(yán)格的標(biāo)準(zhǔn)化流程確保數(shù)據(jù)的可靠性和可重復(fù)性。
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因業(yè)務(wù)調(diào)整,部分個人測試暫不接受委托,望見諒。

檢測項目

SNP檢測:識別單核苷酸多態(tài)性;參數(shù):檢出限0.1%,覆蓋深度30x以上,靈敏度95%。

插入缺失檢測:分析小片段插入或缺失事件;參數(shù):最小檢測大小5bp,特異度98%,誤報率低于2%。

拷貝數(shù)變異檢測:評估基因拷貝數(shù)改變;參數(shù):分辨率100kb,精度±10%,動態(tài)范圍1-10拷貝。

結(jié)構(gòu)變異檢測:識別大片段重排如倒位或易位;參數(shù):最小檢測大小1kb,置信度99%,覆蓋均一性90%以上。

覆蓋深度分析:測量目標(biāo)區(qū)域測序深度分布;參數(shù):平均深度50x,標(biāo)準(zhǔn)偏差小于15%,覆蓋率98%以上。

序列質(zhì)量評估:檢查序列讀數(shù)的準(zhǔn)確性;參數(shù):Q30分?jǐn)?shù)80%以上,堿基錯誤率低于0.1%。

樣本純度檢驗:評估DNA樣本完整性;參數(shù):260/280比率1.8-2.0,污染閾值低于5%。

文庫制備質(zhì)量監(jiān)控:驗證文庫構(gòu)建效果;參數(shù):片段大小200-500bp,接頭連接效率95%,PCR重復(fù)率低于10%。

目標(biāo)區(qū)域覆蓋率計算:量化外顯子覆蓋比例;參數(shù):外顯子捕獲效率95%以上,缺口區(qū)域小于2%。

變異注釋:對檢測變異進(jìn)行功能解析;參數(shù):使用標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)庫如dbSNP,注釋準(zhǔn)確性99%,涵蓋致病性評分。

深度測序驗證:通過高深度復(fù)測確認(rèn)可疑變異;參數(shù):驗證深度100x,變異頻率一致性90%以上。

等位基因頻率分析:計算群體中變異頻率;參數(shù):頻率分辨率0.5%,統(tǒng)計誤差低于1%。

雜合性丟失檢測:識別基因組雜合區(qū)域缺失;參數(shù):最小區(qū)域大小10kb,靈敏度97%,覆蓋均一性85%。

融合基因檢測:分析基因融合事件;參數(shù):融合點精度±5bp,支持讀計數(shù)閾值10以上。

靶向區(qū)域富集效率:評估外顯子捕獲性能;參數(shù):富集倍數(shù)50x以上,交叉污染低于1%。

檢測范圍

臨床診斷樣本:應(yīng)用于遺傳病篩查和確診;簡介:包括患者血液、唾液或組織樣本,用于識別致病突變。

遺傳病研究:支持家族性疾病機(jī)制探索;簡介:在科研項目中分析孟德爾疾病相關(guān)變異。

個體化醫(yī)療:指導(dǎo)治療方案定制;簡介:基于基因型信息優(yōu)化藥物選擇和劑量。

癌癥基因組學(xué):解析腫瘤驅(qū)動變異;簡介:用于識別體細(xì)胞突變和拷貝數(shù)改變。

藥物研發(fā):輔助靶點發(fā)現(xiàn)和驗證;簡介:在臨床前研究中篩選候選基因靶標(biāo)。

動物模型研究:驗證轉(zhuǎn)基因動物基因型;簡介:評估基因編輯動物的遺傳修飾效果。

植物基因工程:加速作物遺傳改良;簡介:應(yīng)用于優(yōu)良性狀選育和抗性基因篩選。

微生物基因組:分析病原體遺傳變異;簡介:用于檢測抗生素抗性基因和毒力因子。

法醫(yī)樣本:支持身份鑒定和親子測試;簡介:處理法醫(yī)生物學(xué)樣本進(jìn)行個體識別。

遺傳咨詢樣本:提供風(fēng)險評估依據(jù);簡介:在遺傳咨詢中輔助解讀家族遺傳風(fēng)險。

群體遺傳學(xué)研究:探索人類進(jìn)化多樣性;簡介:大規(guī)模樣本分析以揭示群體結(jié)構(gòu)。

生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn):識別疾病相關(guān)分子標(biāo)記;簡介:用于開發(fā)診斷或預(yù)后生物標(biāo)志物。

生殖健康檢測:應(yīng)用于胚胎植入前篩查;簡介:分析胚胎樣本評估遺傳異常風(fēng)險。

環(huán)境微生物分析:監(jiān)測生態(tài)系統(tǒng)中微生物群落;簡介:研究環(huán)境樣本的基因功能多樣性。

食品安全監(jiān)控:檢測食品中致病微生物;簡介:應(yīng)用于病原體溯源和污染控制。

檢測標(biāo)準(zhǔn)

依據(jù)ISO/IEC 17025:2017規(guī)范檢測實驗室能力,確保質(zhì)量控制體系。

GB/T 30988-2014規(guī)定DNA測序質(zhì)量要求,包括覆蓋深度和錯誤率。

ASTM E2784-16提供全基因組測序標(biāo)準(zhǔn)指南,適用于變異檢出驗證。

ISO 20395:2018定義生物技術(shù)測序質(zhì)量參數(shù),涵蓋靈敏度測試。

GB/T 35428-2017規(guī)范高通量測序數(shù)據(jù)格式,確保結(jié)果可互操作性。

ISO 15189:2012針對醫(yī)學(xué)實驗室標(biāo)準(zhǔn),應(yīng)用于臨床報告準(zhǔn)確性。

GB/T 33582-2017規(guī)定遺傳變異檢測方法,包括注釋和驗證流程。

ISO/IEC 27001:2013確保數(shù)據(jù)安全和隱私保護(hù),在樣本處理中應(yīng)用。

ASTM E3133-18定義生物信息學(xué)分析質(zhì)量控制,支持變異調(diào)用。

GB/T 34796-2017規(guī)范文庫制備技術(shù)標(biāo)準(zhǔn),覆蓋片段大小和效率。

ISO 5725-1:1994規(guī)定測試方法精密度,用于重復(fù)性評估。

GB/T 1.1-2009標(biāo)準(zhǔn)化文件編寫規(guī)則,指導(dǎo)報告格式一致性。

ISO 9001:2015質(zhì)量管理體系要求,應(yīng)用于整體檢測流程。

GB/T 27407-2010實驗室質(zhì)量控制規(guī)范,涵蓋樣本前處理。

ASTM WK65049草案針對外顯子組測序驗證,確保臨床相關(guān)性。

檢測儀器

高通量測序儀:執(zhí)行大規(guī)模平行測序;功能:生成原始序列數(shù)據(jù),覆蓋目標(biāo)區(qū)域。

文庫制備系統(tǒng):處理DNA樣本構(gòu)建測序文庫;功能:進(jìn)行片段化、接頭連接和純化。

PCR擴(kuò)增儀:放大DNA模板增強(qiáng)信號;功能:用于靶向富集和文庫擴(kuò)增步驟。

生物信息學(xué)分析平臺:處理序列數(shù)據(jù)調(diào)用變異;功能:執(zhí)行比對、變異檢測和注釋分析。

質(zhì)量控制系統(tǒng):監(jiān)控測序運行性能;功能:評估堿基質(zhì)量和覆蓋深度一致性。

DNA定量儀:測量樣本濃度和純度;功能:在樣本前處理中確保輸入量準(zhǔn)確。

電泳系統(tǒng):驗證文庫大小分布;功能:檢測片段長度和完整性。

核酸提取儀:純化DNA從生物樣本;功能:去除雜質(zhì)保證樣本質(zhì)量。

數(shù)據(jù)存儲服務(wù)器:處理和歸檔測序數(shù)據(jù);功能:支持大規(guī)模數(shù)據(jù)管理和備份。

自動化液體處理系統(tǒng):執(zhí)行高通量樣本操作;功能:減少人為誤差提高通量。

檢測流程

1、咨詢:提品資料(說明書、規(guī)格書等)

2、確認(rèn)檢測用途及項目要求

3、填寫檢測申請表(含公司信息及產(chǎn)品必要信息)

4、按要求寄送樣品(部分可上門取樣/檢測)

5、收到樣品,安排費用后進(jìn)行樣品檢測

6、檢測出相關(guān)數(shù)據(jù),編寫報告草件,確認(rèn)信息是否無誤

7、確認(rèn)完畢后出具報告正式件

8、寄送報告原件

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