因業(yè)務(wù)調(diào)整，部分個人測試暫不接受委托，望見諒。

檢測項目

總RNA提取純度檢測：采用紫外分光光度法測定，要求A260/A280比值1.8-2.0，A260/A230＞2.0，濃度≥20ng/μL

rRNA去除效率驗證：通過Agilent 2100 Bioanalyzer檢測，殘留rRNA比例需＜5%，片段分布峰值200-5000nt

cDNA文庫構(gòu)建質(zhì)量評估：片段大小選擇150-500bp，文庫濃度＞2nM，GC含量40-60%

測序數(shù)據(jù)質(zhì)量控制：Q30分值≥90%，有效數(shù)據(jù)量＞5Gb，錯誤率＜0.1%

基因表達定量分析：采用FPKM標準化算法，檢測靈敏度0.01TPM

差異表達基因篩選：|log2FC|≥1且p-adjust＜0.05為顯著性閾值

GO功能富集分析：涵蓋生物過程、分子功能、細胞組分三大類，p-value＜0.01

KEGG通路顯著性分析：篩選關(guān)鍵代謝通路，富集因子＞1.5

sRNA鑒定：識別18-500nt非編碼RNA，定量精度±5%

可變剪切事件檢測：識別內(nèi)含子保留、外顯子跳躍等類型，置信度≥95%

融合基因篩查：支持跨基因讀段≥5條，斷點定位精度±10bp

SNP/InDel變異檢測：覆蓋深度≥30X，變異等位基因頻率＞10%

檢測范圍

臨床病原菌耐藥機制研究：肺炎克雷伯菌碳青霉烯酶表達譜分析

環(huán)境微生物脅迫響應(yīng)：重金屬污染區(qū)域Pseudomonas putida應(yīng)激基因篩查

工業(yè)發(fā)酵菌株優(yōu)化：大腸桿菌重組蛋白表達通量提升的轉(zhuǎn)錄調(diào)控研究

益生菌功能基因組學：Lactobacillus acidophilus腸道定植相關(guān)基因鑒定

海洋極端微生物適應(yīng)機制：深海熱液口Archaea耐熱基因網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建

植物病原互作研究：Xanthomonas oryzae侵染水稻的毒力因子表達動態(tài)

生物膜形成機制解析：銅綠假單胞菌群體感應(yīng)相關(guān)sRNA篩選

抗生素合成途徑研究：Streptomyces coelicolor次級代謝產(chǎn)物合成簇表達驗證

廢水處理微生物群落：活性污泥系統(tǒng)中Nitrosomonas europaea氨氧化通路活性評估

食品發(fā)酵監(jiān)控：發(fā)酵乳制品中Leuconostoc mesenteroides風味物質(zhì)合成基因表達量檢測

病原體宿主適應(yīng)研究：結(jié)核分枝桿菌巨噬細胞內(nèi)潛伏期轉(zhuǎn)錄重編程分析

合成生物學元件驗證：工程菌株啟動子強度定量評估

檢測標準

ISO 20395:2019 生物技術(shù)-核酸測序方法學驗證要求

GB/T 37872-2019 高通量測序數(shù)據(jù)質(zhì)量控制

ISO/IEC 17025:2017 檢測實驗室通用技術(shù)要求

ASTM E3132-18 轉(zhuǎn)錄組測序?qū)嶒炘O(shè)計規(guī)范

GB/T 34796-2017 核酸樣本保存與處理規(guī)范

EN ISO 22118:2011 分子生物學檢測方法驗證指南

GB/T 35823-2018 測序文庫構(gòu)建質(zhì)量控制

ISO 20166-3:2018 分子體外診斷-福爾馬林固定石蠟包埋組織RNA檢測

YY/T 1596-2017 高通量基因測序數(shù)據(jù)準確性評價方法

ISO 20391-2:2019 細胞計數(shù)方法學驗證規(guī)范

檢測儀器

Illumina NovaSeq 6000測序系統(tǒng)：雙流通池設(shè)計，通量10B-20B reads/run，完成全轉(zhuǎn)錄組雙端150bp測序

Agilent 4200 TapeStation系統(tǒng)：通過ScreenTape芯片實現(xiàn)RNA完整性值(RIN)檢測，分辨率1-10000nt

Thermo Fisher Qubit 4.0熒光計：采用dsDNA HS檢測模塊，RNA定量范圍0.1-100ng/μL，精度±5%

Covaris M220超聲破碎儀：聚焦超聲技術(shù)實現(xiàn)RNA片段化，片段大小偏差±15bp

Bio-Rad CFX96實時PCR儀：采用SYBR Green法進行文庫定量，動態(tài)范圍10^2-10^9 copies/μL

Beckman Coulter Biomek i7自動化工作站：完成96樣本并行建庫，移液精度0.1μL

Nanopore GridION測序儀：通過R9.4.1芯片實現(xiàn)直接RNA測序，讀長＞10kb

Eppendorf 5430 R離心機：配備FA-45-30-11轉(zhuǎn)子，最大離心力30,000×g確保RNA沉淀效率

檢測流程

1、咨詢：提品資料(說明書、規(guī)格書等)

2、確認檢測用途及項目要求

3、填寫檢測申請表(含公司信息及產(chǎn)品必要信息)

4、按要求寄送樣品(部分可上門取樣/檢測)

5、收到樣品，安排費用后進行樣品檢測

6、檢測出相關(guān)數(shù)據(jù)，編寫報告草件，確認信息是否無誤

7、確認完畢后出具報告正式件

8、寄送報告原件