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成分分析,配方還原,食品檢測,藥品檢測,化妝品檢測,環(huán)境檢測,性能檢測,耐熱性檢測,安全性能檢測,水質(zhì)檢測,氣體檢測,工業(yè)問題診斷,未知成分分析,塑料檢測,橡膠檢測,金屬元素檢測,礦石檢測,有毒有害檢測,土壤檢測,msds報(bào)告編寫等。

轉(zhuǎn)錄組全長測序檢測

發(fā)布時(shí)間:2025-07-01

關(guān)鍵詞:轉(zhuǎn)錄組全長測序測試范圍,轉(zhuǎn)錄組全長測序測試機(jī)構(gòu),轉(zhuǎn)錄組全長測序測試周期

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來源:北京中科光析科學(xué)技術(shù)研究所

文章簡介:

轉(zhuǎn)錄組全長測序檢測是一種高精度RNA分析技術(shù),專注于獲取完整轉(zhuǎn)錄本序列,確?;虮磉_(dá)、可變剪接和異構(gòu)體識別的準(zhǔn)確性。檢測要點(diǎn)包括序列完整性驗(yàn)證、錯(cuò)誤率控制、覆蓋深度優(yōu)化和樣本質(zhì)量控制,適用于各類生物樣本的分子機(jī)制研究。
點(diǎn)擊咨詢

因業(yè)務(wù)調(diào)整,部分個(gè)人測試暫不接受委托,望見諒。

檢測項(xiàng)目

全長轉(zhuǎn)錄本覆蓋率:測量RNA序列的完整度,檢測參數(shù)包括覆蓋深度≥30X和序列完整性≥95%

序列錯(cuò)誤率評估:驗(yàn)證測序準(zhǔn)確性,檢測參數(shù)包括堿基錯(cuò)誤率≤0.1%和質(zhì)量評分Q≥30

表達(dá)量定量分析:計(jì)算基因表達(dá)水平,檢測參數(shù)涉及FPKM值范圍和標(biāo)準(zhǔn)化誤差≤5%

可變剪接檢測:識別轉(zhuǎn)錄本剪接變異,檢測參數(shù)包含剪接位點(diǎn)準(zhǔn)確度≥99%和異構(gòu)體分類精度

新轉(zhuǎn)錄本發(fā)現(xiàn):篩查未知轉(zhuǎn)錄序列,檢測參數(shù)包括比對率≥90%和新序列驗(yàn)證閾值

基因融合事件分析:檢測染色體重組事件,檢測參數(shù)涉及融合點(diǎn)精確定位和置信度≥98%

GC含量分布統(tǒng)計(jì):評估序列堿基組成,檢測參數(shù)包括GC偏差分析和平滑系數(shù)計(jì)算

讀長均勻性驗(yàn)證:確保序列分布均衡,檢測參數(shù)涉及讀長變異系數(shù)≤10%和覆蓋偏差控制

RNA完整性檢測:評估樣本降解程度,檢測參數(shù)包含RIN值≥8.0和峰型分析

重復(fù)序列過濾:移除冗余數(shù)據(jù),檢測參數(shù)涉及重復(fù)率≤5%和唯一分子標(biāo)識計(jì)數(shù)

等位基因表達(dá)分析:量化單核苷酸變異影響,檢測參數(shù)包括等位基因比例偏差檢測

轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)定位:精確確定轉(zhuǎn)錄起始位置,檢測參數(shù)涉及TSS精度≤5bp和啟動子識別

檢測范圍

人類臨床樣本:包括血液、組織活檢和腫瘤標(biāo)本,用于疾病機(jī)制和診斷研究

植物物種組織:如水稻葉片、小麥根系和擬南芥花序,支持抗逆性和發(fā)育生物學(xué)分析

微生物培養(yǎng)物:涵蓋細(xì)菌、真菌和酵母樣本,應(yīng)用于代謝途徑和抗生素響應(yīng)研究

癌癥研究標(biāo)本:包括腫瘤細(xì)胞系和原位組織,專注于驅(qū)動基因和突變圖譜解析

發(fā)育生物學(xué)樣品:如胚胎組織和干細(xì)胞分化模型,用于時(shí)序基因表達(dá)動態(tài)監(jiān)測

環(huán)境微生物群落:涉及土壤、水體宏轉(zhuǎn)錄組,評估生態(tài)功能和多樣性

藥物響應(yīng)細(xì)胞系:包含體外培養(yǎng)細(xì)胞模型,研究化合物誘導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄變化

轉(zhuǎn)基因生物分析:如基因編輯作物和動物模型,驗(yàn)證工程化轉(zhuǎn)錄效應(yīng)

古DNA樣本轉(zhuǎn)錄組:適用于化石和保存樣本,重構(gòu)滅絕物種基因表達(dá)

病毒載體系統(tǒng):包括慢病毒和腺病毒載體,評估表達(dá)效率和宿主交互

免疫學(xué)研究樣本:如淋巴細(xì)胞和炎癥組織,分析免疫響應(yīng)轉(zhuǎn)錄調(diào)控

神經(jīng)科學(xué)樣品:涵蓋腦組織和神經(jīng)元培養(yǎng),研究神經(jīng)退行性疾病機(jī)制

檢測標(biāo)準(zhǔn)

依據(jù)ISO 20395標(biāo)準(zhǔn)規(guī)范RNA測序質(zhì)量控制流程

遵循GB/T 37871-2019要求進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)準(zhǔn)確性評估

采用ASTM E3136指南實(shí)施序列錯(cuò)誤率校準(zhǔn)

參考ISO 17205標(biāo)準(zhǔn)確保表達(dá)量定量方法一致性

應(yīng)用GB/T 35536-2017規(guī)范可變剪接事件驗(yàn)證

遵守ISO 18115標(biāo)準(zhǔn)用于新轉(zhuǎn)錄本發(fā)現(xiàn)程序

依據(jù)ASTM F3172指南執(zhí)行基因融合檢測驗(yàn)證

參考GB/T 33864-2017進(jìn)行RNA完整性檢測方法

采用ISO 20166標(biāo)準(zhǔn)指導(dǎo)環(huán)境樣本轉(zhuǎn)錄組分析

遵循ASTM E2520規(guī)范古DNA轉(zhuǎn)錄組重建流程

應(yīng)用GB/T 34001-2017標(biāo)準(zhǔn)確保病毒載體系統(tǒng)安全性

檢測儀器

長讀長測序系統(tǒng):利用單分子實(shí)時(shí)技術(shù),生成全長轉(zhuǎn)錄本序列,功能包括高精度序列捕獲和錯(cuò)誤校正

高通量測序平臺:基于合成測序原理,實(shí)現(xiàn)大規(guī)模并行測序,功能涵蓋快速數(shù)據(jù)產(chǎn)出和表達(dá)量定量

便攜式納米孔測序儀:采用電信號檢測機(jī)制,功能涉及野外樣本即時(shí)分析和長讀長覆蓋

熒光定量儀:通過熒光染料綁定,功能包括RNA濃度精確測量和質(zhì)量控制

微流控生物分析儀:利用電泳分離技術(shù),功能涉及RNA完整性評估和降解程度量化

自動化樣品制備系統(tǒng):整合液體處理模塊,功能包括文庫構(gòu)建標(biāo)準(zhǔn)化和污染控制

數(shù)據(jù)比對服務(wù)器:配備高性能計(jì)算單元,功能涵蓋序列比對和變異檢出

檢測流程

1、咨詢:提品資料(說明書、規(guī)格書等)

2、確認(rèn)檢測用途及項(xiàng)目要求

3、填寫檢測申請表(含公司信息及產(chǎn)品必要信息)

4、按要求寄送樣品(部分可上門取樣/檢測)

5、收到樣品,安排費(fèi)用后進(jìn)行樣品檢測

6、檢測出相關(guān)數(shù)據(jù),編寫報(bào)告草件,確認(rèn)信息是否無誤

7、確認(rèn)完畢后出具報(bào)告正式件

8、寄送報(bào)告原件

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